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近日，HorticultureResearch在线发表了河南科技大学郭大龙研究团队和中国农业科学院郑州果树研究所刘崇怀研究团队合作完成的题为“Genome-wideassociationstudyofberryrelatedtraitsingrape[VitisviniferaL.]basedongenotyping-by-sequencingmarkers”的研究论文。
在长期的自然选择、人工驯化和育种过程中，葡萄种质材料中积累了丰富的遗传变异，在葡萄果粒的颜色、发育期、重量、形状、果肉质地和风味等方面显现了很高的多样性。与果实相关的农艺性状多为复杂的数量性状，探究这些性状的遗传基础对葡萄的遗传改良具有重要意义。
图1葡萄果实性状遗传多样性
该研究采用简化基因组测序（GBS）方法，对源自世界各地的份葡萄优良种质材料，基于GEMMA,EMMAX，PLINK和TASSEL四种统计模型，对葡萄果粒颜色，果实发育期，果粒重量，果粒形状，果穗大小，果穗紧密度，果肉质地和果实风味8果实性状进行了全基因组关联分析。获得了均匀分布于全基因组的32,SNP标记（~1SNP/14.26kb），群体结构和遗传多样性分析发现供试材料可分为8个亚群体。研究结果表明，GEMMA的检测效能最佳，果粒颜色性状的定位结果与前人基于遗传群体的结果一致，同时新鉴定出了与多个果实性状显著关联的SNP位点。这些相关位点的鉴定提高了我们对葡萄果实农艺性状遗传基础的认识，为葡萄品种的分子设计和相关基因的克隆提供重要的理论依据，为优质葡萄的育种策略及育种实践的发展提供科学的理论指导。
图2葡萄果实性状全基因组关联分析曼哈顿图和GEMMA模型拟合Q-Q图
HorticultureResearch简介
HorticultureResearch是由南京农业大学与Nature出版集团（现SpringerNature）合作创办的英文期刊，是Nature旗下首本园艺领域专刊，也是目前园艺领域唯一一本中国SCI期刊。所有关于园艺作物的基础和理论研究都可以投稿。HorticultureResearch科瑞唯安影响因子：年JCR影响因子3.，位于园艺一区（第2/37名）；植物科学一区（第31/名）。为园艺领域唯一一本中国SCI期刊。中科院期刊分区影响因子：年中科院期刊分区影响因子3.，3年平均影响因子3.。位于园艺领域一区（第2/35名）；植物科学二区（第21/名），被评为农林科学大类TOP期刊。为园艺领域以及农林科学一区中唯一的中国SCI期刊。在线投稿
